REP、RAPD和PFGE方法在志贺菌分子分型中的应用评价

李琦；姜大栋

关键词：REP, RAPD, PFGE, 志贺菌分子, 分型

摘要：目的：探讨REP、RAPD和PFGE方法在志贺菌分子分型中的应用效果。方法以细菌基因组重复序列（REP）、随机扩增多态性分析（RAPD）、脉冲场凝胶电泳（PFGE），分别对60株志贺菌分子进行分型，并对3种方法加以评估。结果 REP、RAPD和PFGE的分子分型结果显示，采用REP方法，有A、B两型；采用RAPD方法，有A、B、C、D、E、F六型；采用PFGE方法，共有3个亚型，其中，51株可分为A、B、C、D、E五型，其余6株宋内志贺菌为1单独型。结论在3种分子分型方法中，REP对高菌株分辨率差，在区域内菌株分型方面，不具优势；RAPD分辨率高、分型精准，但需花费较长时间；PFGE明显优于前二者，分型效果更为细致，三者之间的差异性显著，但PFGE操作更简便，用时更少，价格更低，而且对于细菌性痢疾暴发事件，有较好的病学调查效果。